La tentative de conciliation prônant le retour d'Hélène dans ses foyers ayant échouée la guerre contre Troie était inévitable. Aux conseils de sa mère, qui lui proposait le choix entre une vie courte et brillante et une vie longue mais obscure, Achille avait répondu qu'il préférait la gloire, la vie fut-elle brève. Thétis devait donc rapidement trouvé une solution pour essayer d'arracher son fils à son tragique destin car les préparatifs avaient commencé.
A neuf ans le devin Calchas avait prédit que Troie ne saurait être prise sans le concours d'Achille, c'est pourquoi, Thétis le retira de chez Chiron et l'envoya, déguisé en jeune femme, à la cour de Lycomède dans l'île de Skyros pour essayer de le soustraire à son funeste destin.
• Caché dans le gynécée sous le nom de Pyrrha (Πύρρα, la rousse), une prétendue sœur d'Achille, il séduisit Déidamie, fille du roi Lycomède, qui n'avait pas été bien longue à découvrir la supercherie et qu'il épousa secrètement quelque temps avant son départ pour Troie.
De cette union naquit un fils, Néoptolème (ou Pyrrhus), qui participera lui aussi à la guerre car sa présence était également nécessaire à la victoire.
Selon les prédictions de Calchas, les Grecs ne pouvaient s'emparer de Troie sans la présence incontournable d'Achille, ils chargèrent Ulysse de le retrouver et de le ramener rapidement.
Le rusé roi d'Ithaque se déguisa en marchand ambulant et présenta aux jeunes filles de la cour de Lycomède des bijoux parmi lesquels était placée une épée. Quarante neuf jeunes filles se précipitèrent sur les bijoux et les pièces d'étoffes tandis que la prétendue princesse Pyrrha saisit avec empressement l'arme lorsqu'Ulysse fit sonner une trompette de guerre. Démasqué, Achille suivit Ulysse sans qu'il y ait eu un engagement vis à vis d'Agamemnon.
• Toutefois Homère ne relate pas cet épisode et Pélée envoya directement son fils et Patrocle à la tête de Myrmidons rejoindre la flotte grecque; de même le récit du premier départ de la flotte. En effet les chants cypriens (ouvrage aujourd'hui perdu) racontent que les navires poussés par les vents arrivent en Mysie et les grecs attaquent la ville croyant avoir affaire à Troie. La ville est âprement défendue par Télèphe, le fil d'Héraclès. Alors qu'il est captif des pampres de vignes déployées par Dionysos Télèphe est blessé par la lance d'Achille. Finalement les grecs comprenant leur erreur retour sur leur base. La blessure ne guérissant pas Télèphe décide de se rendre à Mycènes pour se faire soigner par Achille. Achille commence par refuser arguant qu'il ne connait rien à la médecine puis en échange d'informations sur la localisation de Troie il accepte de le soigner avec la rouille de sa lance, sorte d'homéopathie avant l'heure.
• Avec une cinquantaine de navires, Achille rejoignit Agamemnon à Aulis pour un second départ mais la flotte grecque était bloquée cette fois par des vents contraires car Agamemnon avait offensé Artémis soit pour avoir tué une biche consacrée à la déesse, soit pour s'être vanté d'être meilleur chasseur qu'elle.
Toujours selon le devin Calchas la flotte ne pourrait partir pour Troie tant que la fille du roi ne serait pas sacrifiée à Artémis. Or Iphigénie se trouvait à Mycènes et Agamemnon ne savait pas très bien comment la convaincre de venir au port d'Aulis. Puis, poussé par Ménélas et surtout par Ulysse, il accepta de faire venir sa fille sous le prétexte fallacieux de la fiancer à Achille.
Achille qui n'avait pas été informé de cette honteuse démarche, en fut indigné et chercha à sauver la malheureuse Iphigénie. Il ne pardonna jamais à Ulysse cette tromperie.
Iphigénie allait périr sous le couteau du sacrificateur, quand Artémis, décida de lui substituer une biche, l'enleva dans une nuée, et la transporta à Tauride pour en faire sa grande prêtresse. Toutefois selon d’autres auteurs (Eschyle), Iphigénie est sacrifiée.
Et les bateaux enfin purent lever l'ancre.